为全面贯彻党的二十大和二十届三中全会关于教育、科技、人才协同发展的战略部署，落实中组部、教育部关于工程硕博士改革和加强卓越工程师学院建设的精神，持续深化工程科技人才培养改革，加快构建卓越工程师自主培养体系，着力培养国家急需关键领域高层次战略人才，东华大学于2023年成立卓越工程师学院，2024年入选首批上海市卓越工程师学院建设单位。

东华大学卓越工程师学院实行理事会制，东华大学联合政府部门、科研院所、行业企业等共同成立了卓越工程师学院理事会，是学院发展规划和重大事项的领导与决策机构。东华大学为理事长单位，长三角国家技术创新中心和G60科创走廊为副理事长单位。理事会主要负责统筹资源，发挥东华大学、行业企业等联合共建单位资源优势，促进教育链、人才链、产业链、创新链深度融合、有机衔接。设立卓越工程师学院学位评定分委员会，负责卓越工程师学院工程硕博士研究生的培养方案、毕业标准、学位授予等工作。